Имало е античен град Пергам,който е предшествал Перперикон. Това обяви в края на археологическото лято там проф. Николай Овчаров. Той е датирал между II и IV век, a това доказват намерените крепостни стени от това време. Това е периода на римската епоха, когато градът е бил в разцвет, ограден от крепост с дебелина на стената 3 м и височина на кулата 8 метра. В същото това време Троя се разпада.
Думата "пергам" е тракийска и означава "мощна крепост".
Градът Пергам според описанията на Клавдий Птолемей се намирал някъде в Източните Родопи. За 1-ви път той е бил идентифициран през 1801г. от Ромен Жюли - личен картограф на Наполеон. В картата му за първи път е изобразена р. Арда, наричана тогава Арпезкос.
Името Перперикон е познато от византийските извори едва от 12-ти век.В продължение на години историците се опитваха да разчетат старото име на свещения град и да докажат, че това е митичния Пергам.