Медицински център на МБАЛ-Бургас - "Св. Николай Чудотворец", вече е преместен в новия хирургически корпус на болницата, до Спешно отделение. Промяната е направена за удобство на пациентите, които вече могат да ползват денонощно кабинетите му с талон от здравната каса. Директор на Центъра вече е д-р Нигохос Топузян, досегашен шеф на Спешно отделение на бургаската болница.
На разположение на пациентите има 12 кабинета - очен, кардиологичен, ортопедо-травматологичен, урологичен, нефрологичен, хирургичен, УНГ, АГ, неврологичен, педиатричен, гастро-ентерологичен, хематологичен. В близост са рентгенът и клиничната лаборатория.
От 1 януари 2012 се планира разширение на дейността. Предвижда се разкриване на кабинет по съдова хирургия, както и прегледи по желание от специалистите на болницата.