Инсталацията следва да работи при спазване на следните условия – генерираните от хуманното здравеопазване отпадъци трябва да се събират в пластмасови торби, като острите отпадъци се поставят в плътни съдове, непозволяващи пробиване. Ежедневно, по график торбите с отпадъците трябва да се пренасят до обособеното помещение за междинно съхраняване.
Помещението за съхраняване на отпадъци от оперативни интервенции трябва да бъде оборудвано с хладилни съоръжения, поддържащи температура – (минус) 10 градуса, в случаите когато предаването на отпадъци не е ежедневно.
Измерването и контролирането на количествата на постъпващите или образуваните отпадъци трябва да се извършват посредством визуален контрол и тегловно, като се документират в отчетни книги за отпадъци.